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甲基化實(shí)驗( Methylation experiment )
來源: | 作者:1 | 發(fā)布時間: 1883天前 | 565 次瀏覽 | 分享到:
DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學(xué)修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現(xiàn)。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結(jié)合一個甲基基團(tuán)。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達(dá)。

背景知識 :

DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學(xué)修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現(xiàn)。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結(jié)合一個甲基基團(tuán)。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達(dá)。

主要檢測方法:

亞硫酸氫鈉測序法 (Bisulfite Genomic Sequencing PCR, BSP

用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,則未發(fā)生甲基化的胞嘧啶被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變。隨后設(shè)計BSP引物進(jìn)行PCR,在擴(kuò)增過程中尿嘧啶全部轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶,*后對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序就可以判斷CpG位點(diǎn)是否發(fā)生甲基化稱為BSP-直接測序方法。將PCR產(chǎn)物克隆至載體后進(jìn)行測序,可以提高測序成功率,這種方法稱為BSP-克隆測序法。

甲基化特異性的PCR Methylation Specific PCR, MSP

用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變;隨后設(shè)計針對甲基化和非甲基化序列的引物進(jìn)行PCR。通過電泳檢測MSP擴(kuò)增產(chǎn)物,如果用針對處理后甲基化DNA鏈的引物能得到擴(kuò)增片段,則說明該位點(diǎn)存在甲基化;反之,說明被檢測的位點(diǎn)不存在甲基化。

客戶需提供 :

組織標(biāo)本或純化好的符合實(shí)驗要求的 樣本,檢測的基因信息,相關(guān)文獻(xiàn)等。

*終交付:

實(shí)驗報告單,MSP電泳圖/ BSP測序圖等。





  
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